Cette décision est liée, selon le chef de la diplomatie bissau- guinéenne, à l'affaire des 74 Syriens arrivés mardi à Lisbonne venant de Bissau, porteurs de passeports bissau-guinéens, et qui ont demandé l'asile politique au Portugal.
M. Delfim da Silva a déclaré à la presse que sa démission "est un signe de protestation contre le sort des Syriens".
Il a promis de donner plus tard des précisions sur les circonstances dans lesquelles 74 Syriens se sont rendus à Lisbonne.
Cette affaire des Syriens est par ailleurs à l'origine de la décision de la compagnie portugaise TAP de suspendre sa desserte de Bissau "pour des raisons de sécurité".
TAP affirme que les Syriens avaient été embarqués de force à Bissau par des militaires bissau-guinéens dans son avion alors que leurs documents de voyage n'étaient pas en règle.
Les ressortissants syriens sont soupçonnés de voyager avec de faux passeports bissau-guinéens délivrés en Turquie.
Mais, ces informations ont été catégoriquement démenties par le directeur général adjoint des services de migration, qui a affirmé que les passeports ont "délivrés à Bissau et sont des vrais".