La première victime a été tuée par une grenaille dans la tête et transféré à l'hôpital El Kaser Aany, tandis que le corps de la deuxième victime a été retrouvé abandonné à la place Abdel Moniem Reyad, près de Tahrir, par un manifestant.
Les forces de sécurité enquêtent sur l'incident, a indiqué le rapport.
Pendant les affrontements entre les forces de sécurité et les manifestants mercredi matin, certains des assaillants inconnus ont tiré une cartouche et causant des blessures mortelles à d'autres personnes sur la place, a montré une enquête préliminaire.
Le nombre de morts au Caire depuis le deuxième anniversaire de soulèvement du 25 janvier est de trois, tandis que les pertes totales à travers le pays sont plus de 60 morts et près de 2.000 blessés.
Lors d'un discours dimanche, le président égyptien Mohamed Morsi a attribué les affrontements sanglants a des "mains pécheresses" qui ont dévié de la protestation pacifique et d'expression d'opinions à une agression armée et au vandalisme.