Dans sa structure la plus aboutie, la FAA aura une effectif total de 30 000 soldats de la paix fournis par les Etats membres, à raison de 6000 soldats pour chacune des cinq régions naturelles du continent : Nord, Sud, Ouest, Est et Centre. La FAA ne constituera pour autant pas une armée permanente. Chaque contingent restera cantonné dans son pays d’origine, prêt à se déployer dans une zone de conflit à la demande de l’Union africaine.
