M. Le Floch-Prigent a été interpellé mi-septembre 2012 en Côte d'Ivoire et extradé vers le Togo le lendemain pour son implication dans une affaire d'escroquerie internationale d'un homme d'affaires émirati Abass El Youssef estimée à 48 millions de dollars.
Il souffre d'un cancer de peau qui serait à une étape critique. Sa situation a fait l'objet, depuis des mois, de beaucoup de tractation de ses avocats et de sa famille pour sa libération de sorte à lui permettre de suivre des soins appropriés en France
L'affaire a éclaboussé l'ancien ministre togolais de l'Administration territoriale Pascal Bodjona, également en détention, tout comme un homme d'affaires togolais Bertin Sow Agba qui est présenté, avec Le Floch-Prigent, comme les pièces maîtresses de l'escroquerie.