Un homme a lancé une grenade sur les gens faiant la prière dans un endroit à ciel ouvert à Mtwapa, à 15 km au nord de la ville.
L'assaillant ont pris la fuite en profitant de la confusion causée par l'explosion, a confié à Xinhua un policier.
Selon des informations non confirmées, une seconde attaque à la grenade se serait produite à Stadium Inn, près du stade municipal de Mombasa.
Plus tôt ce mois, neuf personnes avaient été tuées à Nairobi dans une attaque à la grenade visant une station de bus.
Le Kenya a été frappée par plusieurs attentats à la grenade, attribuées aux combattants des shebab ou leurs sympathisants, depuis le mois d'octobre 2011, où des troupes kenyanes étaient entrés dans le territoire somalien pour attaquer les rebelles somaliens.