Le tanker a été chargé sur le terminal pétrolier du Cap Lopez de Port-Gentil, dans le sud-ouest du pays.
Dans le passé, la part du pétrole brut gabonais était commercialisée par la compagnie privée Pétroline dont le siège est à Genève en Suisse.
La GOC a par ailleurs obtenu en décembre son premier permis de recherche de l'or noir.
"La création de cette société permettra au Gabon d'avoir une maîtrise de toute la chaîne de l'industrie pétrolière de la recherche à la production, jusqu'à la commercialisation", avait annoncé le chef de l'Etat gabonais, Ali Bongo Ondimba, le 5 mars 2011 à Port-Gentil.
Le pétrole constitue la première source de devises au Gabon, qui représente environ 60% du budget de l'Etat.